숲속에서 큰 뱀에게 쫓기던 타미노 왕자가 밤의 여왕의 세 시녀(요정들)들의 도움을 받는다. 지나가던 사냥꾼은 타미노 왕자에게 자신이 뱀을 죽였다고 거짓말하자, 요정들은 사냥꾼에게 말을 못하는 벌을 내리고, 타미노 왕자는 밤의 여왕을 만나서 파미나 공주에 대해서 이야기를 듣는다. 밤의 여왕은 자신의 딸이 사라스트로라는 왕에게 납치되어 갇혀 있다며, 왕자에게 구해달라고 청한다. 왕자는 파미나 공주의 사진을 보고 한눈에 사랑에 빠졌기 때문에 기꺼이 하겠다고 대답했고, 사냥꾼도 함께 구출하러 가게 되는데, 요정들은 왕자에게 사람의 마음을 움직이는 마술피리를 주고, 사냥꾼에게는 마술벨을 준다. 그들은 성에 갇혀있는 파미나 공주를 구출하러 가지만, 사라스트로에게 걸려서 3가지 테스트를 거쳐야만 파미나 공주를 데리고 갈 수 있다고 하여, 힘든 테스트를 받고 타미노왕자와 파미나 공주는 결혼을 하게 된다.
